Lançado em 2019, o Prêmio João e Maria de Educação visa reconhecer o comprometimento das escolas públicas apoiadas pelo IJMB em alfabetizar todas as crianças na idade certa. Além de consagrar os esforços das escolas, a iniciativa representa também um momento de valorização da educação pública como agente de transformação social.
Atualmente, o Prêmio é voltado para escolas públicas das redes apoiadas pela organização, com turmas de Pré-escola e 1º e 2º anos do Fundamental e que tenham participado do Projeto Letras do Saber — iniciativa do Instituto que promove assessoria para técnicos da secretaria e formação para gestores escolares e professores.